De directie van CSG Willem de Zwijger uit een rector en een conrector. De vier afdelingen - onderbouw, vmbo-t, havo en vwo - worden geleid door teamleiders. Directie en teamleiders vormen samen de schoolleiding.

Rector is de heer M. Hakkenberg.

De heer W.J. Krajenbrink is conrector.

Teamleider onderbouw is de heer A.T. Seton.

Het vmbo-t-team staat onder leiding van de heer B.J. Geurtsen.

Drs. J.B. de Jong geeft leiding aan het havo-team.

Het vwo heeft als teamleider de heer H.R.H.A. de Boer.